國發會除原經濟建設委員會，納入研考會及部分公共工程委員會工管處管考業務，員額由 300多人倍增至700餘人。
目前研擬的國發會組織架構，包括綜合規畫處、經濟發展處、社會發展處、產業發展處、人力發展處、國土區域離島發展處、管制考核處、資訊管理處、檔案管理局、法制協調中心等。
由於員額增加，目前經建會主要人員辦公大樓無法容納倍增的員額，經建會官員指出，行政院通過以國發基金編列預算興建國發大樓，未來可集中各單位人員，提高效力。
官員表示，國發大樓的總工程費用約新台幣8億多元，工期約2至3年，盡量將分散的各單位整併在一起。
不過，國發大樓的工程預算尚未經立法院同意通過。