第1屆兩岸和平論壇下午針對兩岸政治關係、涉外事務、安全互信等3項議題進行閉門研討，均未開放媒體採訪。據與會者轉述，與會的不同立場者在會中各抒己見，觀點南轅北轍，也不時相互反駁觀點，但整體氣氛大致平和。
據與會者轉述，這場論壇下午研討兩岸政治關係議題時，童振源在報告中，曾引用對台灣民眾進行的兩岸關係民調，其中包括「兩岸是否同屬一個中國」等議題，並認為大陸應該重視台灣的民意。
但廈門大學台灣研究院院長劉國深隨後發言說，這些民調數字反映了台灣民眾的意見，但並沒有反映大陸民眾的意見。若要準確了解民意對兩岸問題的看法，也應對大陸民眾作相同的民調。
劉國深還說，作民調要小心，因為民調會「忽悠（矇騙）人」。並指台灣的民調「不可靠」，「是亂源中的亂源」，受訪者「真的懂得什麼叫國家嗎？」這類民調的結果「真的有營養嗎？」
童振源對此回應，「民調」和「調查」不同，因為需要取樣，但它對顯現民意的趨勢，仍然有一定的準確度。至於向大陸民眾進行民調，在技術上有一定程度的困難。
另外，廈門大學法學院教授陳動表示，台灣人十分重視「情」字，因此他建議大陸針對兩岸關係議題與台灣互動時，「得理也要讓三分」，才能較好地爭取台灣的民心。