外界質疑高廣圻代理部長職務為何一夕之間就換成楊念祖，抄襲事件有嚴重到要請辭下台的地步嗎？如果是他本身寫作抄襲，那就是人格操守的問題，請辭下台並不為過，但是因為有人代為執筆涉及抄襲就請辭下台未免也太過牽強！究竟楊念祖為什麼要在這個時候選擇下台？到底當初是馬英九強迫楊念祖臨時披掛上陣而楊找到機會順勢下台，還是國軍內部人事卡位鬥爭把楊逼下台？箇中皆顯示內情頗不單純和啟人疑竇！更別提連該書的原作者即軍事專家費學禮都表示「想不透」，覺得楊的下台理由「不符邏輯、很愚蠢」！
如果馬英九要落實文人領軍的競選政見，就不應該派現任的軍職參謀總長嚴明當部長，因為以往擔任過副部長的林中斌、張良任皆是可以考慮的人選，為什麼不用？事實上，目前面臨多事之秋的國防部必須大刀闊斧地進行改革，可以考慮找資深老將，例如：霍守業、林鎮夷、謝建東等人出任，才穩得住陣腳帶領國軍。但為什麼沒有老將願意出來呢？最大原因在於馬英九於官僚體系上用完就丟、有事就切割的行事作風，但連在最講究倫理的軍方用人哲學竟也是如此，馬不會體恤下屬，難怪根本沒有人願意出來為他賣命。現在臨時找一個素有「軍中乖乖牌」的現役軍人嚴明來接任部長，難道這樣就能鎮得住、壓得住現在軍方紛亂的情勢嗎？他能夠讓軍方執法人員的素質和訓練足夠嗎？他真的可以在每個管理階層的認知裡強化軍方的人權教育嗎？再說，從他過去的歷練和行徑來看，他真的可以讓洪案真相大白、有魄力地對軍方進行總體檢和建立起現代化的管理制度嗎？《孫子謀攻篇》曰：「夫將者，國之輔也。輔周則國必強，輔隙則國必弱。」
另外，筆者發現各大媒體皆未報導和提起之處，即洪案發生當時，前任部長高華柱人在國外，洪仲丘所屬的542旅是陸軍的部隊，屬於軍令系統（參謀總長），按照正規及倫理，應該是由參謀總長負責！為何洪案卻是高華柱下台？從頭到尾看不到的參謀總長嚴明現在反而升任部長呢？一週內部長下台了2個，難道總長沒有責任？由此顯見，依照馬英九的用人邏輯，真正該負責的不必下台，只要聽話的還可以升官！這樣主責國防、外交權的三軍統帥－總統，還有威信領導國軍？國軍會信服嗎？國防部長非一般內閣部會首長，行使任免對國家安全相當重要，審查能如此草率嗎？馬英九急於安撫民怨卻不詳查人選，終於創造了國際上的大笑話！史無前例！無怪乎馬英九被國際媒體經濟學人直轟笨拙無能
洪案發生至今，這段期間，令民眾相當心痛、覺得不捨，民眾對家屬的煎熬感同身受，產生同理心，對政府處理過程感到失望。換言之，社會之所以對洪仲丘案如此關切、議論，就是因為不滿意政府對此案的處理態度。吾人看到的是一個不肯面對社會，以及不能坦白誠懇面對各方質疑的政府。然洪案已成無關藍綠的全民大事，這絕非是個案，這是對馬英九執政的信任危機。台灣社會在此時表現出對政府和軍方的不信任，顯示政府長期以來在軍隊文化、心態和體制上，未能進行整體的檢查和必要改革。普羅大眾希望經過了洪案事件，社會可以深刻反省，瞭解台灣軍隊所面臨的問題，希望自此不會再有類似憾事發生，並期待這是社會改革的開始。
最後，筆者和國人一樣呼籲政府，這個問題十分嚴重，很多年輕子弟在從軍過程中不幸過世，也有莫名消失的情事，多少爸媽和家屬收到了噩耗？我們希望洪案是最後一件！若馬政府仍不能查清洪案真相，以一個謊言掩蓋另一個，也不通盤檢討軍中弊病，那麼筆者預告，「拆政府」的日子近了！