軍檢31日偵結陸軍義務役下士洪仲丘死亡案，除了把洪仲丘送進禁閉室的542旅旅長沈威志等人被要求從重量刑之外，負責管理禁閉室的陸軍269旅禁閉室室長蕭志明、副室長宋浩群與羅濟元、以及李念祖等7名管理士，總共10人都依刑法「業務過失致死」罪嫌被提起公訴。
至於外界關注的管理士陳毅勳，則因凌虐洪仲丘，軍檢則是以陸海空軍刑法「上官藉勢凌虐軍人致人於死」等罪嫌起訴，建請法院從重量刑，最高軍事法院檢察署檢察長曹金生說：『(原音)陳毅勳對洪仲丘的死亡結果顯有預見，且洪員於遭受凌虐後當日即因過度體能操練中署，並於送醫後仍因中署及併發嚴重合併症而死亡，其凌虐行為與洪仲丘的死亡結果，卻有相當因果關係。』
根據陸海空軍刑法第44條規定，上官凌虐部屬致人於死者，處無期徒刑或7年以上有期徒刑。
北部地方軍檢署檢察長吳逸聖表示，陳毅勳犯行「純粹是出於他自己凌虐的犯意」，他的操課強度明顯比其他管理士更高，更在洪仲丘舉手表達身體不適時，反以言語譏諷，全然漠視洪仲丘身體狀況已瀕臨極限。