日前有平面媒體以社論批評高中歷史教科書採用「日治時代」而非「日據時代」，引發社會廣大討論。行政院22日發出新聞稿表示，針對「日本殖民統治時期」簡稱「日治」或「日據」的討論，教育部基於課綱規範及教科書開放民間編寫的立法意旨，在學術討論範疇中，尊重編者依歷史事實所做的詮釋，以保障憲法所定表達意見自由。因此，在教科書審查上，行政院尊重教育部同時接受「日據」及「日治」用字的決定。
不過，行政院表示，基於維護中華民國國家主權及民族尊嚴立場，行政院本於政府行政機關權責，在公文書處理上將統一使用「日據」用語，並通函中央及地方機關依照辦理。