行政院衛生署表示,這是自民國六十年衛生署成立以來,最大幅的變革,以能因應人口結構的改變及新型態社會的挑戰,強化健康及福利照顧,及全方位照顧國人生、心理及社會各層面,並符合WHO全方位覆蓋( Universal Coverage )的世界潮流。
將掛牌成立的衛生福利部是由原衛生署署內單位(含任務編組)與5個所屬機關,加上內政部社會司、兒童局、家庭暴力及性侵害防治委員會、國民年金監理會,以及教育部國立中國醫藥研究所等單位整合而成,經過重新規劃為8司6處及6個所屬三級機關(構)。
此外,除原有26家衛生署醫院,並移入13家原隸屬內政部之社會福利機構。內政部也配合這次業務移撥隨同移撥人員共計1291人,未來內政部配合行政院組織調整,內政部現有國家公園、下水道、營造產業及農民健康保險等業務、預定將再移撥至環境資源部、交通建設部及農業部。