在立法院的要求下，行政機關委託中華經濟研究院再次提出服務貿易協議評估報告，不過兩岸官員認為，由於經濟模型只更新到2007年，因此整體效益被低估了，未來政府更新經濟模型後，會再提出更詳盡的報告，屆時外界可檢視服貿協議對台灣的影響。
中經院日期提出服貿協議新版評估報告，但外界質疑內容報喜不報憂，更拿出三年前中經院有關ＥＣＦＡ的報告與今日做對比，暗諷中經院公信力不足。
根據中經院提出的新版報告顯示，未來協議生效後，國內生產毛額（GDP）可成長0.025%至0.034%，換算約9700萬美元至1.34億美元。
不願具名兩岸官員強調，中經院評估報告依據「多國貿易分析模型」（GTAP Model）最新版資料庫進行模擬，但由於GTAP資料庫龐大，5年才能更新一次，因此中經院所引用的數據，其實是2007年所建立。
他強調，由於兩岸許多經貿政策2008年後才上路，若加上這層因素，其實服貿協議的效益是被低估而不是外界所謂的膨風。
此外，服貿協議開放的電子商務、醫院、證券、教育等產業，相關效益也沒有出現在GTAP模型中。他透露，GATP模型將在今年10月進行更新，屆時會用新的數據為基準，再提出一份評估報告。
至於相關數據評估，當協議生效後，預計可替台灣創造1萬1千多個就業機會，另外台灣對大陸服務業出口成長也會成長4成、相當於4億美金，當然會有部份產業受到影響，這點政府會提供後續保障措施。