台南市農業局副局長郭伊彬表示，台紐經濟合作協定簽署後，預計以12年時間逐步開放紐西蘭鹿茸零關稅進口，國內養鹿產業勢必會受到衝擊。全台灣的800多戶鹿農現共畜養約2萬2000頭；台南市有95戶養鹿戶，飼養1歲以上的公鹿超過2000頭。
台南市養鹿協會理事長姜財福表示，鹿茸是國內民眾喜愛的補品，台灣國產鹿茸每年產量約24公噸，進口鹿茸約5公噸。紐西蘭人沒有消費鹿茸的習慣，養鹿業主要以供應鹿肉為主，鹿茸僅是副產品，且幾乎都是在宰殺後才取下的，與國產鹿茸不同。
姜財福指出，台灣民眾習慣購買現採新鮮鹿茸，冷凍的進口鹿茸與國產品有一定的市場區隔，短期內紐西蘭進口鹿茸對市場衝擊不會太明顯，但12年後全面零關稅、且大量進口後，局面可能不一樣。
郭伊彬指出，市府將採取推動健康管理、標章認證、開發新產品及市場區隔等因應措施，協助鹿農提升產品的附加價值，把危機化為轉機。