立法院朝野協商決定「海峽兩岸服務貿易協議」必須送立法院逐條審查、逐條表決，但是陸委會交給立委一份「海峽兩岸服務貿易協議立法院處理程序建議」，其中提到尊重委員會逐條討論，但認為應由院會「全案表決」，更強調「立法院只能作批准與否的決定，而無法逐條審查修改」。對此，立法院長王金平今天(26日)表示，案子送進立法院後，該怎麼處理，由立法院決定，陸委會的意見只是參考。王金平說：『(原音)案子送到這裡來，立法院怎麼處理是立法院的事，他們的建議我們當作參考就好。』