立法院31日在會期最後一天夜襲三讀通過會計法第99條之1修正案出現大烏龍，因為修正條文漏「教」字，導致教授恐無法因此除罪，國、民兩黨團昨天都認為該修正案的適用對象包含教授，將請司法單位解釋，但法務部今(5)日一早發布新聞稿指出，法務部非主管機關，應由主管機關或立法機關參酌立法目的、文義解釋等為解釋，至於具體個案方面，仍由司法機關做統合性見解，法務部不便表示意見。
會計法修正條文是於5月31日深夜三讀通過，依憲法規定，應由總統先送請行政院長副署；若副署後，再依憲法規定在10天內公布，即6月10日是最後公告日。
但其間傳出漏字烏龍，以致該修正案的適用範圍至今仍無定論，國民黨團主張先由行政院、司法院釐清，若有誤才循修法途徑解決；民進黨團則稱應由政院提覆議補救，但政院已表明不會提覆議，馬英九總統也只說「尊重國會程序」。
另台聯總召林世嘉在昨天因會計法修正案惹議一事，也已請辭黨職，台聯正研議另提修正草案，只針對教授部分除罪；至於民代部分，將修正立場，反對除罪，亡羊補牢。
法務部今天一早更發布新聞稿重申，政次兼發言人陳正堂表示，會計法修法中所稱「職員」固然包括教授兼任行政職之系院所主管、學校行政主管及首長等，至於是否包括未兼行政職教授，法務部並非主管機關，應由主管機關或立法機關，參酌立法目的、文義解釋等為解釋，至於具體個案方面，仍由司法機關做統合性見解，法務部不便表示意見。