立法院財政委員會初審通過的證所稅修正版本為：證所稅取消8500點天險，散戶免徵，且民國104年後售出股票金額超過新台幣10億元大戶，採設算課稅為主、核實課稅為輔；選核實課稅可盈虧互抵，稅率15%，選設算所得為差額課稅，稅率為千分之1；修法後，實施時效回溯到今年1月1日。
然而面對此版本，朝野立委除了取消8500點天險有共識外，大戶條款、IPO課稅批評聲浪不斷；最後朝野協商破局，修法仍未通過三讀。
民進黨團總召集人柯建銘表示，回顧證所稅修法過程，民進黨提出「量能課稅」修法版本，卻不被接受；如今政府要再推證所稅修法，行政院不提版本，藉國民黨籍立法委員版本讓大戶逃避繳稅、只針對初次上市櫃股票（IPO）核實課稅、扼殺中小企業發展，這種證所稅「不要也罷」。
他進一步表示，從國民黨版本的證所稅修法可看出，政府想將景氣不好責任歸咎於證所稅，並將證所稅未修正通過對台股影響的責任嫁禍民進黨。
台聯黨團副總召許忠信則說，放大戶、課小戶稅將造成租稅不公，如果要通過不公平的證所稅修法，「我寧可回家教書」。
面對在野黨聯手杯葛，國民黨團書記長賴士葆表示，證所稅修法維持IPO核實課稅是底線，「退無可退，不可能再改」。黨團決定在臨時會期間間、6月23日朝野協商期滿後，就交付院會表決處理。