包括雄獅旅遊、康福旅行社等都表示，願意讓已訂位的旅客退費。截至今天的統計估算，已退費的旅客約3成多，3成多的旅客選擇以優惠價轉到其他東南亞團，另外還有3成的旅客在觀望。觀望的旅客多是遠期的旅客，他們認為未來台菲關係將轉好，有機會再解禁。
台灣不滿菲律賓對「廣大興28號」案的回應，祭出制裁。觀光局指出，外交部對菲律賓發布紅色旅遊警示，就是不宜前往，觀光局也已行文給各個旅行社，如果執意要組團，則是違反「經營旅行業務不遵守交通部觀光局管理監督之規定者」的規定。
中華民國旅行商業同業公會全國聯合會說，菲國長灘島、宿霧行程一直滿到7月，而且都已經全部付款。經協調航空業者和旅行社後，包括菲律賓航空、飛龍航空、遠東航空和華信航空已經同意包機退款，但酒店款項還有待與菲律賓方面再協調。
全聯會指出，機票約占全部行程費用的40%。
全聯會表示，台灣1年赴菲律賓約21萬人次，占總出國人數僅約5%，不過台灣旅客卻是菲律賓外籍旅客的大宗，排到第5名。
全聯會估計，禁止團客赴菲，台灣的旅行社每年損失約25億元營業額，如果只有禁止今年的5、6、7月，損失約5億元。