台灣與日本簽署漁業協議後，未來台灣漁民在「協議適用海域」的作業權益將獲得保障，不再受日方驅趕。
行政院長江宜樺9日在行政院會聽取外交部函送我國與日本簽署的「台日漁業協議」後表示，台日簽署漁業協議是我國外交上非常重大的突破與成就，也是馬英九總統主張「東海和平倡議」的具體成果。他感謝相關部會的努力，也希望未來能有更進一步的發展。行政院發言人鄭麗文轉述：『(原音)除了要感謝外交部的努力，也特別感謝海巡署、農委會、漁業署、亞東關係協會及陸委會等相關機關的共同努力，希望未來在類似經濟海域重疊的地區，也能有令人肯定的發展。』
外交部也表示，日前在亞東關係協會前會長廖了以與日本交流協會會長大橋光夫於台北完成協議的簽署後，歷經17年、進行16次會議的台日重疊專屬經濟海域漁業問題終於獲得具體成果。