交通部表示，炸彈案發後，行政院長江宜樺18日指示相關單位檢討。交通部25日邀請台灣高鐵、台灣鐵路管理局、內政部警政署、行政院國土安全辦公室等開會後，決定從安全人力、安全設備和法規修正等三個方向著手。
交通部指出，未來高鐵、台鐵的車站的強化安全工作包括加強鐵路警察的巡邏密度、全面檢視各車站的監視器密度和角度，各重要車站配置防爆毯、評估車站設置行李X光機的可行性等。
在法規修改方面，將修改鐵路運送規章，規範鐵路機構得針對可疑危險物品經旅客同意後檢查，如果旅客不同意，鐵路機構得拒絕運送。
交通部並將於下週內完成危險品分類及名稱研訂，公布讓旅客知道哪些是危險物品，哪些不得攜帶上車，並要求台灣高鐵公司及台鐵局立即在車站明顯處所公告。