國內24日傍晚確診首例境外移入H7N9流感病例，而依據中央流行疫情指揮中心26日召開記者會表示，到26日上午8時為止的24小時內，共接獲13起H7N9流感疑似病例通報，創下機場、醫院防疫以來通報件數的新高。台北市政府擴大應變等級，設置24小時服務專線；呼籲民眾勿恐慌，做好「6不3要」防治措施，於大陸返國後自主健康管理10天，如有出現發燒、咳嗽等類流感症狀時，請戴口罩速就醫。
台北市25日提升應變等級，開設應變中心，市長郝龍斌呼籲市府團隊務「禦敵從嚴，料敵從寬」，並請陳雄文副市長擔任召集人，督策積極配合中央防疫政策與執行各項H7N9流感防治工作。對於全國傳統市場禁止屠宰活禽防疫政策，北市市場處已著手針對全市177位攤商進行配合意願調查與輔導工作，原則上希望能於5月17日前完成相關輔導與相關設備等準備工作。
其他包括加強禽肉攤販、活禽販售市場、私有市場及鳥街防治宣導與稽查；加強禽流感疫情監測，擴大採樣頻度與地點數；加強禽流感稽查，禁止民眾於公園、廣場等處餵食野鴿；加強確診個案接觸者之健康監測10天，如有疑似症狀立即協助就醫；針對台北市所有被通報疑似H7N9流感個案，由防疫同仁加強追蹤至健康狀況完全康復為止；加強傳染病防治應變醫院與隔離指定醫院整備；加強應變醫院及指定隔離醫院周邊消毒與感染性廢棄物及汙水處置監控；整備防疫物資：及持續加強禽流感防治衛教宣導工作。
市府請民眾勿恐慌，落實6不3要禽流感防治措施，及大陸返國後做好自我健康管理10天。市府並再次宣導「6不」：1.不餵食候鳥及一般禽鳥。2.不至禽流感流行地區參觀禽鳥。3.不購買來路不明的禽鳥肉品。4.不買不吃罹病禽鳥。5.不自行宰殺禽鳥。6.不生吃禽鳥肉蛋及相關製品；以及「3要」：1.要勤洗手，接觸禽鳥肉、排泄物及生雞蛋後，要肥皂洗手。2.要熟食，禽流感病毒不耐熱，60℃加熱30分鐘或100℃加熱1分鐘即可殺滅。3.要提高免疫力。