南投發生規模6.1地震，台中市各大型醫院在地震發生時都啟動緊急應變機制，護理人員協助疏散病人，還好應變得宜，沒有發生重大意外，只有林新醫院發生門診病人被砸傷意外。
林新醫院公關室主任吳士桂表示，一名50多歲女性門診病患地震發生時，正在櫃檯辦理批價手續，被牆壁剝落的壁磚砸中右前耳及耳際的部位，導致約2公分的傷口，送往急診室緊急縫合8針，為慎重起見，院方將病人留置加護病房觀察。
署立台中醫院在地震發生時隨即啟動應變措施，做好因應大量傷患準備，護理人員也緊急疏散住院病人及門診病人，只有電腦系統受到影響，醫院暫時以人工進行掛號及批價作業，約半小時後，電腦就恢復正常。
台中醫院說，地震後，醫院收治7名傷患，大部分是手腳擦傷，只有一名48歲學校女性教職人員在奔往戶外避難時跌倒，因左手骨折送醫開刀治療。
中國醫藥大學附設醫院有多棟大樓，院方表示，大樓電梯都有避震設施，在地震時自動停止，讓乘客走出來，而開刀房也有備用電源及備用水，一切都井然就序，沒有造成騷動。
台中榮總指出，平時都有根據各種狀況演習，地震後逐樓訪視住院病人，雖然地震後網路出現塞車情形，但醫院有自己的應變設施，電腦運作正常。
林新醫院說，地震後隨即啟動危機處理，針對院內機電設施進行檢測，了解電梯、電力、氣體管路等有無問題，在2小時的檢測過程中，並沒有影響門診作業。