台灣日本腦炎流行季節主要在5月至10月間，高峰期常發生在6到7月，但是天氣逐漸暖化，使得日本腦炎有提早開始流行的趨勢；根據台南市衛生局統計，去年該市自5月底發生日本腦炎首例後，全年共有9人確定感染日本腦炎，病例分別分布在北區、善化區、麻豆區、安平區、永康區、北門區及白河區等7區，年齡最小位於麻豆區的22歲男性大學生，最大則在安平區75歲男性。
台南市衛生局表示，目前疫苗接種是預防日本腦炎最有效的方法，現行幼童日本腦炎疫苗接種時程為出生滿15個月接種第一劑，間隔2週接種第二劑，隔年接種第三劑，滿5歲至國小一年級入學前接種第四劑，請家長儘速帶幼童按時完成疫苗接種。
另外，衛生局指出，成人如因工作或生活中有感染之虞者，也可前往行政院衛生署胸腔病院、行政院衛生署立台南醫院或新化分院、行政院衛生署立新營醫院等自費接種。
日本腦炎潛伏期為5至15天，感染後致死率可高達20%至30%，而存活的病患多數導致腦炎及嚴重之神經後遺症。豬是日本腦炎流行最重要的病毒增幅動物，三斑家蚊為主要傳播媒介，且三斑家蚊吸血高峰期為黃昏與黎明時分；該局特別呼籲民眾應注意做好防蚊措施，並請醫師提高警覺加強通報。
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