台灣大學人權與法理學中心主任顏厥安指出，國科會補助學術研究經費，受到採購及會計等僵硬制度限制，不但成為我國學術發展阻礙，更引發人才流失危機，尤其是司法機關最近以不當法律解釋，對學者進行廣泛的犯罪偵查、起訴及定罪，更是非常不可思議。
成功大學法律系副教授許澤天直言，無論國立還是私立大學教授，使用假發票就是不對，但也不能濫用刑法對使用假發票學者。若是使用假發票「以Ａ報Ｂ」，把請領的錢用在跟研究無關或者是私人用途，教授既非「授權公務員」，就不適用貪汙罪偵辦，應屬於詐欺罪；若是名實不符的錢，全部用在研究上，若未造成他人財產損失，自然也不涉及詐欺。
「我們完全沒有辦法接受研究人員研究經費拿去做私人用途！」台北大學法律系副教授徐育安譴責學者把研究經費中飽私囊，卻也認同許天澤主張以詐欺罪追究「公款私用」學者。他以個人親身經歷，批評國科會經費核銷制度僵化，「我以耗材名義申請購買資料夾，但會計人員卻說，資料夾是設備，不能用耗材名義申購。」