台灣水資源保育聯盟主張，六輕揮發性有機化合物（VOCs）涉嫌超標法定限制每年4302噸的總量80倍之多，要求環保署應命令六輕停工。
行政院環境保護署對此回應，六輕相關計畫排放的VOCs排放量計算，屬於雲林縣政府權責，環保署已依立法院決議，督導雲林縣政府召開由權益相關各方，推薦專家召開會議加以釐清。
至於環團要求環保署命令六輕停工一事，環保署指出，六輕相關計畫因工安事件造成空氣污染，雲林縣政府已經依法要求塑化輕油廠、烯烴一廠、南亞二異氰酸甲苯廠、異辛醇廠等停工。
環保署表示，雲林縣政府既已依權責要求六輕相關生產線停工，台灣水資源保育聯盟應檢據六輕相關排放VOCs超過每年4302噸總量相關證據，提供雲林縣政府作為六輕復工申請審查的參考，呼籲環保團體勿錯置戰場。