在巴基斯坦與阿富汗，美國中央情報局藉遙控無人飛機，打得蓋達和同路人塔利班好戰分子抬不起頭來。只有在西方情報仍然所知有限的北非偏遠地區，尤其在阿拉伯之春引發北非地區動盪不安之際，蓋達分子顯然有可乘之機。
據英國「每日郵報」（Daily Mail）報導，北非蓋達分子和他們的武器，主要來自利比亞。在西方協助反對派勢力推翻並殺害格達費之後，寄生利比亞的蓋達分子越界流竄到鄰國馬利北部，並計畫南下侵占馬利所有國土作為安全庇護所在。
但在法國出兵介入後，蓋達分子劫持阿爾及利亞一座擁有700多名員工的天然氣廠為手段，企圖以其中來自26國136名外籍員工的生命要脅西方撤出馬利。未料阿國政府以阿拉伯快刀斬亂麻方式，在雙方僵持4天後即展開軍事突擊並結束事件，造成約40名外國人質遇害喪生，29名綁匪遭擊斃，3人被捕。此一事件凸顯出蓋達分子有意立足北非的強烈企圖。
911事件之後，美國前總統小布希下令發動「反恐戰爭」，打擊任何與蓋達有關連的組織和人物，先後揮兵攻進阿富汗與伊拉克，推翻塔利班政權與伊拉克總統海珊。
無論是在阿富汗或是伊拉克，西方聯軍確是希望建立一個穩定的民主政體，但文化與思維的不同，尤其一個是外來強權的占領者，一個是自認被占領的受害者，導致911的怨未解，結卻是更多了，結果是永無止境的血腥暴力與屠殺。
這樣的發展，也導致原本對英美西方國家並無強烈印象的人，包括伊拉克、阿富汗以及其他地區數以百萬計的穆斯林，現在都成為西方國家的敵人，製造了更多的蓋達分子。
如今極其明顯的是，蓋達組織已非當初以為的一小撮人或單一集團而已，實際已成為許多組織和支派，並且散布在許多國家，包括阿富汗、巴基斯坦、伊拉克、葉門、利比亞、埃及等伊斯蘭強硬派當家做主的國家，而動盪不安的北非地區，也儼然成為蓋達組織不斷變裂茁壯的溫床。