二代健保補充保費今年1月1日上路，然而卻引發不少爭議，台灣團結聯盟立法委員林世嘉今（7）日表示，補充保費新制嚴重衝擊打工族及非典型勞工，要求立即檢討補充保費制度，並回歸家戶總所得制作為二代健保的經費來源。台大工會秘書長黃守達痛批，政府遲遲不願承認大學研究、教學助理的勞工身分，但對研究生開徵補充保費卻不手軟，實在不合理。
林世嘉與民進黨立法委員鄭麗君今天上午召開記者會，直指二代健保對在學的研究生開刀，徵收這些兼職學生的補充保費，造成許多研究生生活雪上加霜，補充保費制度已經嚴重衝擊打工族與非典勞動者，健保局應該立即停止徵收，重新以家戶總所得研擬健保經費來源。
林世嘉指出，全國擔任兼職助理的研究生超過4萬人，如果以2%補充保費計算，每位兼職碩博士生每年至少多繳2000元補充保費。她還說，以1名博士生國科會計畫兼職助理來說，每月收入28800元，每個月的補充保費就是576元，但是如果是1名月薪28800元的上班族，其補充保費卻只要繳424元，工作不穩定的研究助理反而繳得多，這顯然不公平。
在校擔任研究助理的台大政治學研究所博士生江俊宜表示，自己每個月薪水28000元，每週工作5天與一般上班族無異，還要兼顧自己的論文研究，繳的補充保費卻比上班族還多，讓他有種因為博士生身分而被懲罰的感覺。
家裡是低收入戶的輔大法文所碩士生謝承叡則說，自己每月擔任助理的薪水僅6000多元，扣掉5000元生活費後剩下的都給家裡，現在又要繳更多的補充保費，他痛批：「難道政府只會找弱勢學生開刀？」
黃守達表示，台大工會去年一直要求政府認可大學兼職研究助理的勞工身分，然而卻遭到政府一再否定，而這些不具勞工身分、無法投保勞保的助理，政府卻要向他們徵收補充保費，簡直是一頭牛剝兩次皮。他也質疑，同樣是在校兼職，為何大學生不用抽補充保費，碩、博士生卻要繳補充保費？
鄭麗君認為，這些從大學畢業的研究生，畢業後還要負擔學貸，但是補充保費卻是如此苛刻，讓學生負擔家庭經濟費用之餘還要被開刀，她痛批：「這根本是一個假改革的制度」。鄭麗君強調，政府應在3個月內予以檢討，若沒有檢討完善，則應暫時停止徵收，「希望政府能夠三思，如此苛刻不公，連窮學生都不放過」。
衛生署健保小組副召集人曲同光回應表示，補充保費是在現行一般保費之外，針對其他所得所課徵，基本對象是「所有人」，只要有收入所得就會計算在內，絕非針對研究生而已，其基本概念就是「大家有所得就要共同分攤」。至於大學生則考量其未成年、尚無經濟自立能力，因此也將下限額度拉高到基本工資；而低收入戶則有規定不需繳納補充保費，中低收入戶也有「拉低下限」的規定。