元旦升旗典禮昨清晨六點半登場，不少民眾早在四、五點鐘就湧至廣場等待。向台東縣借來的兩枚熱氣球，也已蓄勢待發。當馬英九總統率政府首長戴上新年版的國旗圍巾抵達會場，全體肅立唱國歌時，為新年初始創造了感動的一刻。
儘管民眾熱情勝於去年，但今年周美青並未現身，副總統夫人蔡令怡也沒有出席；而五院院長中只有立法、行政和監察三院院長出席。府方表示，周美青缺席係因另有行程，且第一夫人出席升旗並未形成慣例，除了去年與建國百年元旦外，馬英九上任頭兩年的元旦升旗，周美青也沒有參加。
馬英九致辭時表示，去年就職時誓言打造幸福台灣，至今他與執政團隊都沒有偏離實現人民富裕、幸福為施政首要目標的軌道。依規畫，當馬說到「熱氣球將乘載全民的夢想和政府的承諾升空，幸福指數和經濟成長像熱氣球一路高飛」時，懸掛「民富國強、台灣向上」字條的熱氣球應隨即升空。不過因南廣場風勢不穩，掛有「民富國強」的氣球在升空後又被風吹下，引來一陣驚呼，還有人直呼兆頭不好。
由於日前馬英九在公開場合遭丟鞋抗議，今年升旗典禮安檢格外森嚴。憲兵特勤人員首次配備最新型頭戴式影音記錄器，可隨視線同步錄影。民眾入場前須通過三道安檢關卡，詳細檢查隨身物品。