教育部組織改造1月正式上路，原30個一級單位整併為15個，形成8司、6處、1會，並新設3個三級機關，其中又以「國民及學前教育署（以下簡稱國教署）」最受矚目。
新任國教署長吳清山是國中教師出身，後來投入學術界，長期任教於台北市立教育大學教育行政與評鑑研究所。他同時也有豐富的行政經歷，先後擔任台北市政府教育局長、國家教育研究院院長，參與教育政策研擬多年，對十二年國教知之甚詳。
全國教師工會總聯合會秘書長吳忠泰表示，吳清山是講究「人和」的人，10幾年下來，對於社會各界的聲音都傾聽的很徹底，不會偏聽、偏信。尤其面對教育改革，行政單位、家長、教師、學生的立場多有差異，不宜向任何一端傾斜。
吳忠泰表示，目前十二年國教較爭議的部分，包括基北區特色招生用PISA題型、國中會考難度比基測還難，造成國中生未蒙其利、先受其害。另外各縣市免試推動進度不一，導致「一國多制」狀況，先一步推動全面免試的宜蘭縣、花蓮縣、台東縣、金門縣等，能否成為正面的領航者，而非負面的白老鼠，都需仰賴吳清山的智慧。
全國家長團體聯盟十二年國教民間辦公室執行長謝國清表示，吳清山對教育非常熟悉，尤其是攸關成敗的「課程改革」，在國教院長任內投入頗多心力；另外像是「家長參與」，吳清山任教時也有相關著作，期許他掌握行政權力後，能有所突破。
不過，謝國清說，吳清山行事較「溫文儒雅」，面對需要強烈改革、辯護的政策，謝國清擔心吳清山無法應付。
一名熟悉教育界的人士也指出，吳清山在擔任台北市教育局長任內，適逢市長郝龍斌大力推動「一綱一本」、「北北基自辦基測」政策，各界反彈聲浪不斷。吳清山基於教育專業，曾挺身而出、表達和北市府不同的意見，卻不能力抗到底，最後黯然離職。
後來北北基基測試辦一年就告中止，證明吳清山當初的擔憂是正確的，不少人為他抱屈。
這位教育人士認為，吳清山現在擔任國教署長，面對的情勢和先前有許多類似之處，十二年國教是「既成政策」，由教育部次長陳益興一手掌控推動，作為下屬的吳清山，能否反映民意，適時地「踩煞車」，讓配套措施更為充足，值得各界觀察。