郭台銘指出，台灣在智慧財產權處於「中游」地位，上游是歐美先進國家，台灣企業必須支付智慧財產權權利金，但下游比台灣落後的國家，台灣卻收不到權利金。台灣企業在研發方面不斷努力付出，但是現在的處境卻是遭到「上下夾殺」。
郭台銘認同張忠謀對智慧財產權導致企業毛利偏低、阻礙台灣創新的看法。郭台銘指出，要解決這個問題，先要了解根本問題核心。專利概念最早出現於歐美市場，因此，歐美業者很早就透過結盟的方式組成所謂的「專利聯盟」，台灣在無法參與相關聯盟的前提下，如何與大陸相關業者合作，發展出屬於「大中華市場專利」的聯盟組織，也將是兩岸業者必須共同處理的問題。
郭台銘以鴻海與比亞迪纏訟為例，自2006年起，鴻海即控告比亞迪侵權，但纏訟6年多，「光訴訟費就超過200萬美元，生意上直接、間接的損失，更超過6億美元！」因此如果兩岸業者要共同合作發展，如何透過法律保障，讓兩岸業者在討論專利與智財權上，可擁有平等的地位，將是重要關鍵。
郭台銘先前即曾經表示，台商與大陸最多的糾紛事項，為「私人」對「私人」性質的侵權糾紛，絕大部分的智慧財產權糾紛，是屬於私人對私人侵權糾紛的範圍，但到目前為止，大陸在侵權糾紛的解決機制尚未建立完備，私人對私人非合約性質的侵權糾紛保障也相當缺乏，這是兩岸在洽談投保協議時，應先解決的問題。
郭台銘強調，企業當然要不斷的研發，以鴻海為例，目前在美申請的專利數是9名，而每年單花在申請專利的費用即達10億元，如果包括研發的費用，將超過數十億元，這也是鴻海保護自己的方式。但除了企業努力研發，取得智財權外，還必須結合政府的力量，建議政府應將每年編列的科技預算，只訂定發展方向，由民間企業來申請，只有民間企業才了解什麼是有用的專利！