近年醫病紛擾不斷，不論是開錯刀或醫師擔心刑責而婉拒醫治病人，造成諸多憾事。據衛生署統計，每年提報醫審會鑑定的醫療糾紛達五五○件，實際醫療糾紛更可能多達五千到六千件，醫病關係處於緊繃狀態。
現行醫療法第八十二條規定，醫療機構及醫事人員執行業務致生損害於病人，以「故意」或「過失」為限，負損害賠償責任。新增第八十二條之一進一步釐清醫事人員刑事責任，除非是故意，若屬於醫療可容許風險的過失，可排除刑事責任。
不過，醫療行為是否有無過失，仍應以當地醫療水準、醫療設施等客觀情況來判斷；若偏離醫療常規致死，仍有刑法業務過失致死罪責。
此外，《醫療糾紛處理及醫療事故補償法》草案建立一套調解機制，未來若發生醫療糾紛，病人提請民事訴訟前，應先經過調解程序，否則不得提起民事訴訟。進入刑事訴訟中的案件，檢察官或法官取得家屬同意，也可移送調解。
根據該草案，政府將設醫療補償基金，做為醫療糾紛補償來源，並設調解會審查評鑑；基金一年約需至十到十二億元，政府公務預算最高分擔三成，其餘基金來源包括醫院、菸品健康捐等相關收入。
補償原則採補大不補小，僅限於死亡、重大傷害兩類，前者上限兩百萬元、後者一五○萬元，並於兩個內完成審查，補償金額另訂之。衛生署解釋，補償限於兩類是要避免醫療人員認為無須負賠償責任，影響自律與醫療品質。
再者，即使病人獲得補償金，最後若法院判決認定醫療糾紛是醫療機構或人員過失，將由政府向醫療機構或醫療人員請求返還賠償金。
衛生署官員解釋，以往曾發生病人採用醫事人員的道歉言語進行提告，希望爭取更多賠償金額。這次草案限制調解與民事訴訟手段只能二擇一，民眾獲補償後又提起民刑事訴訟，就要退還補償金。