馬表示，政府秉持「低調、零意外」的原則，令美方充分掌握台美與兩岸關係的動態，以期恢復與美方高層的互信；馬說，台灣與美方的合作關係，不只在軍事，除美國已給予台灣免簽證待遇外，包括反恐、反擴散及人口販運防制等方面，也都有具體成果。
馬指出，他希望雙方儘速恢復台美貿易暨投資架構協定（ＴＩＦＡ）的協商，用堆積木的方式，逐漸擴展台美雙方經貿合作關係，也歡迎美國重返亞洲再平衡的政策，同時希望台灣能在美國的協助下創造足夠的條件，加入ＴＰＰ。
馬也強調，對於區域內任何多邊的經濟整合機制，台灣都希望能夠參與，包括東協十國與主要貿易夥伴所組成的ＲＣＥＰ（區域全面經濟夥伴關係），這能加快台灣加入全球經貿體系的速度。
至於東海情勢問題，馬指出，政府提出東海和平倡議，希望各方透過協商對話，緩和可能發生的衝突，擱置爭議來開發資源，這也是他所主張的「主權不能分割，資源可以分享」；馬說，政府正在草擬東海行為準則，希望相關聲索國在此基礎上展開協商，使東海成為和平與合作之海，確保區域和平與穩定。