兩岸航線佔復航營收比重約30%，現行開放陸客自由行的13個城市中，復航飛航的航點已有6個，包括第1階段開放的上海、廈門，第2階段的天津、重慶、杭州及福州。
復航說，大陸的一、二線城市因空域與時間帶資源相當有限，想要再大幅增加航班可能性不高，因此最近新增的航點皆為二線有潛力的城市，不僅可以分流主要城市的載運需求，也創造出新的市場商機，提高經營績效。
復航還說，兩岸直航航點超過8成是大陸沿海重要城市，有超過4成的兩岸航班從松山機場進出，交通便利，在競爭激烈的兩岸航線經營上可保有優勢。
目前復航的機隊包括A320、321，以飛航5小時以內的航程，是最適合飛行兩岸的機種，未來將持續進行的機隊汰舊換新與升級。