沒搜林辦公室 結案前才傳林父
民間司改會執行長林峯正律師指出，本案是重大貪瀆案，特偵組卻似乎很相信被告和關係人的供詞，只是把人問一問和測謊就「統統都買單」，這與過去檢方辦案高度懷疑相關供詞，事後反覆查證的作法差別很大。
供詞及測謊 特偵組統統都買單
林峯正還認為，如把林益世母親「燒掉」的九十五萬美金從起訴書拿掉，整個案子的贓款就會兜不攏，似乎這些美金沒燒掉，特偵組就沒辦法結案；至於特偵組沒追究林益世要求中鋼和子公司，更改廠商遴選投標資格，也相當不可思議。
律師徐國勇指出，特偵組偵辦此案時並沒有搜索行政院，還說時間過了這麼久，很多證據可能都滅失，而交給行政院政風室調查，該搜的該扣的沒做，能不讓人起疑？
陳啟祥的辯護律師黃帝穎昨也表示，犯罪嫌疑人多會在案件曝光第一時間湮滅證據，不留給司法當證據，特偵組從頭到尾沒去行政院搜索秘書長辦公室，「這是政治考量，幫馬政府留點顏面」。前台北律師公會理事長黃瑞明指出，以林益世行事風格和處事態度，卻能久居國民黨黨鞭要職，其中暴露出來的國會文化和政治風氣，更讓人憂慮。
對於相關質疑，特偵組說，林益世當時已被收押，加上他已辭職，所有物品已打包仍未搬走，雖未執行搜索，但檢方透過政院秘書處將林的公、私人物品都帶回特偵組，過濾查無犯案證據。
另幾天前首度傳喚林仙保到案，發現林仙保的聽力不好，思路也不清楚，很多問題都要重複很多次才聽得懂，且相關資金流向與林仙保無關，因此排除涉案。
媒體曾揭露林益世向陳啟祥索賄時被偷錄音的背景聲中，隱約還有高雄市環保局駕駛建華在講電話說：「管ㄟ，我在仙仔這。」檢方說，傳訊相關當事人比對錄音內容，當時建華說的是：「川ㄟ，我建華啦，在仙仔這。」建華並非和中鋼集團高層管新灣對話。