中科四期二林園區用水爭議不斷，今年8月行政院國家科學委員會宣布中科四期二林園區轉型為精密機械園區計畫，已完成報院程序。
行政院環境保護署9日召開「中部科學工業園區第四期（二林園區）開發計畫環境影響差異分析報告及變更審查結論」（簡稱中科四期二林園區）專案小組會議，與會環團代表提出程序問題，因此主席裁示擇期續審。今天上午再次召開審查延續會議。
開發單位表示，這次變更以引進低用水產業為原則，放流水量調降為2萬CMD（每日處理立方公尺），農業用水調降為每10日1.52萬噸，揮發性有機物排放量調降為每年200公噸，源頭改善措施排除銅製程產業，以減輕環境負荷。
環團代表指出，根據實地觀察，農田水利會水井在夜間仍在抽水，顯見農業用水嚴重不足，如果再調撥農業用水給中科四期，可能造成超抽地下水使地層下陷加劇；而開發單位提出的用水計畫書還在經濟部水利署審查，尚未申請同意，環評委員應退回中科四期環差。
彰化縣政府代表為解決人口外移問題，極力爭取中科四期二林園區的計畫，但雲林縣政府代表則對中科四期用水和放流水等有意見，雙方一度僵持不下。
主席最後裁示補件再審，希望開發單位從環境、技術、管理、經濟等面向，針對廢水全回收再利用提出完善方案，並規劃可能污染物的管制措施。