馬總統在國慶談話除提到提高薪資水準、擴大就業機會，也提及捍衛主權漁權，推動區域和平。總統說，釣魚台列嶼是中華民國領土，不容侵犯，但他提出「東海和平倡議」，主張相關各方擱置爭議、共同開發資源，同樣的原則，也適用於南海。
政治大學國際關係研究中心研究員鄭端耀表示，他觀察到馬總統在提及釣魚台爭議時，強調「同樣原則」適用南海，有將東海、南海等量齊觀的味道，值得後續觀察。
鄭端耀說，總統國慶講話中對釣魚台爭議的部分，語氣緩和，主要都是重申之前提過的內容，並無新的主張。
除此之外，馬總統花了許多篇幅，談論與日本的經貿關係持續改善，航空班機、航點持續增加，日商來台投資成長等。鄭端耀認為是在對日本釋放友善訊息，緩和之前釣魚台衝突的緊張氣氛。
對於釣魚台爭議的另一方中國大陸，馬總統也提及將通盤檢討修正兩岸人民關係條例，並儘速推動兩岸互設辦事機構。鄭端耀說，從整篇講話的內容來看，馬總統對日本、大陸都有照顧到，一方面對日示好，一方面也避免讓對岸感覺台灣一面倒向日本，「兩邊應該都會感到溫暖」。
政大國關中心第二所所長蔡增家表示，日本外相玄葉光一郎日前對台喊話，並希望重啟中斷了3年多的台日釣魚台列嶼周邊海域漁業權談判，釋出善意後，各方都在看馬總統會如何回應。
蔡增家表示，從今天的國慶講話來看，馬總統發言比之前在彭佳嶼的談話緩和許多，但內容仍是強調過去一貫立場，並無進一步的積極回應，連漁權談判時程等細節都沒提及，顯然仍在觀察日方的後續動作。