曾經讓人詬病的淡水河，在經過多年整治後，水質已經大有改善。行政院環境保護署指出，如今的淡水河水質已是近30年來的最佳狀態，嚴重污染的河段比例已從10年的21％改善到2.6％，且不缺氧的溶養率也從72％提升到92％，加上全流域設置多座現地處理設施和河濱公園，目前是民眾休閒遊憩的去處。
經過多年整治，環保署證實淡水河的水質已大有改善，是近30年來的最佳成績。（圖片／取材自「經濟部水利署」網站）
環保署表示，蜿蜒流經雙北市的淡水河是維繫500萬人的生命之河，曾經是髒污與惡臭的代名詞，但經過長期整治，平均水質已從中度污染改善至輕度污染。
在不缺氧（溶氧大於2ppm）合格率上，已從91年的72％及96年的82％，提升至101年1至8月的92％；不發臭的指標，也就是嚴重污染河段比率，已從由91年的21％及96年的10％，改善至101年1至8月的2.6％；在活化水岸部分，也將沿岸高灘地，蛻變為兼具淨化水質與生態棲地的人工濕地達1300公頃，污染河段越來越短，為30年來水質及水岸環境最好的時期。
目前淡水河全流域污水下水道接管已達120萬戶，並以每年增加9萬戶持續邁進。尚未接管地區也設立34座截流站，截流污染濃度較高之排水。
目前淡水河全流域已設置23座現地處理設施，除淨化水質，還兼具生態復育及環境教育效益；水岸邊亦建置40座河濱公園及濕地，面積達1300公頃，相當於50座大安森林公園或4座紐約中央公園。
環保署指出，由於水質的改善，淡水河的生機也重現，依據近期完成之淡水河流域生態調查結果，魚種自75年約56種，成長至101年的87種，近年來累計有紀錄的魚種更超過100種以上，魚類群聚多樣性顯著增加。另外，在97-98年調查消失多年的日本禿頭鯊，也已重新出現於新店溪碧潭河域，活化了淡水河的生態樣貌。