海洋巡防總局表示，該船約四七二四噸，從巴布亞新幾內亞載運原木，要赴大陸福建省晉江市港口卸貨，船上有三名中國籍、四名菲律賓籍和九名印尼籍船員，還有一名菲律賓籍船長吉納共十七人。
新幸運三號昨日中午十一時許，經過台灣海峽至淡水外海時，遇上七至十級陣風，浪高五公尺，海象惡劣；固定原木的鋼纜也未緊綁，經長時間上下左右搖晃，原木開始在船上滾動，甚至衝破鐵柱，一根根「噗通」落海，船身也開始傾斜。
國搜中心獲報立即派遣兩架海鷗及空勤直升機，在下午二時十五分先將七人吊掛送往台北長庚醫院。另九人於一小時後，由海巡署淡水海巡隊，以巡防艇接送至淡水漁人碼頭。
據船員供述，當第一個救生艇放下海面之際，菲律賓籍船長吉納立即一躍而下，疑因「跳不準」而落水，令船員當場傻眼，儘管吉納身穿救生衣，仍被怒濤吞沒下落不明。