林益世涉收賄案，名嘴與週刊牽扯出地勇遭斷料，是王啟明所指示；但高雄市環保局對外說明，是地勇污染環境嚴重且開罰無用，才依規定對地勇執行「源頭管制（俗稱斷料）」，通知上游停止對地勇供料，決策沒有政治力或外力干預。王啟明事後對週刊等提告。
法務部後來函請台灣高等法院檢察署轉由高雄地檢署行政調查，調查結果認為，王啟明提供民眾檢舉資料給高雄市政府環保局辦理，並一起進行聯合會勘。
法務部表示，王啟明善盡檢察官應有責任，絕無不法與不當，也沒有指示高雄市環保局對地勇公司斷料，王啟明與地勇公司遭斷料一事完全無關，媒體與名嘴的說法與事實不符。