養豬超過兩千頭以上的「大戶」，早已被環保局管制，每天都必須上網填寫廢棄物處理狀況，且禽畜戶依規定都必須設廢污處理場，或委託由合法廠商代為處理。
農業處二月起開始推動禽畜場與農民簽訂再利用合約書計畫，這也是全國唯一實施的縣市。則是以中大型禽畜戶為主，其中包括九家規模較大的蛋雞或肉雞場，目前共七十七家業者配合，其中四十三家業者自行處理禽畜糞，卅四家與農民簽訂再利用合約。
農業處昨天再度召開宣導說明會，畜產科長吳子和表示，依廢棄物清理法、畜產法規定，禽畜糞本來就要妥善處理，現在只是加強落實。
農業處長劉榮堂也說，台東縣生雞糞肥使用量大減，屏東、台南等養雞戶受不了，全國養雞協會發函給縣府，要求解除管制；也有在地禽畜戶抱怨，生禽畜糞處理腐熟約需七十五天，人力、場地均不足，但縣府還是必須依法處理。
他表示，長期來說，已有業者表達想在台東設生禽畜糞代處理場的意願，至於目前則輔導農友集合設地區小型處理設備，目前全縣約廿個產銷班設置。