備受大陸台商關注的兩岸投保協議條文，對於投資人與投資所在地的爭端解決，即投資人主張另一方相關部門或機構違反投保協議規定的義務，致使該投資人受到損失所產生的投資爭端，將可依下列五種方式尋求解決：包括兩造自行協商；由投資所在地或其上級的協調機制協調解決；由投保協議所設投資爭端協處機制協助解決；依據投資所在地一方行政救濟或司法程序解決。
對投資商務糾紛處理，協議規定，一方投資人與另一方自然人或法人訂立商務契約，可就投資所產生的商務糾紛訂立仲裁條款。如未訂立條款，可於爭議發生後協商提交仲裁解決。
同時，商務糾紛的當事雙方可選擇兩岸仲裁機構及雙方同意的第三地仲裁地點。如商務契約中未約定仲裁條款，可於爭議發生後協商提交兩岸仲裁機構，在雙方同意的仲裁地點解決爭議。
對台商關切的人身安全保障，協議僅做原則規範，即雙方應加強投資人在投資中的人身自由與安全保障，依各自規定的時限履行與人身自由相關的通知義務，完善既有通報機制。
協議條文並明訂「公共採購」不適用兩岸投保協議。大陸商務部司長李成鋼在記者會說，公共採購經常是指向「政府採購」，與貿易領域較為相關，因此並不適用於兩岸投保協議。
海關合作協議則規定，兩岸將逐步實施「優質企業」（ＡＥＯ）相互承認並給予通關便利。兩岸海關並將開展各項領域的合作，包括：對各自海關監管中應用無線射頻識別技術（ＲＥＩＤ）的方法，進行交流與合作；建立與ＥＣＦＡ貨品貿易有關的海關電子資訊交換系統等。
陳雲林將於今日上午參觀海基會大直大樓後，結束此行返台。知道大陸人現在很夯台灣鳳梨酥，海基會這次特別選了六六○盒來自南投埔里的「旺來春秋」鳳梨酥，當作採訪江陳會中外媒體的伴手禮。除取其口感，也相中產品名稱隱含吉祥興旺、久久遠遠的意義。