立法院今（25）日召開臨時會，下午表決通過「美牛案」後，緊接著處理「復徵證券交易所得稅」，不滿國民黨團提出之「證所稅」版本，民進黨團及台聯黨團都退席表示抗議，最後，於在野黨全數退席的情況下無異議通過《所得稅法》部分條文修正草案。停徵許久的證所稅將在明年復徵，頭2年先採「設算所得」和「核實課徵」雙軌制，2015年則全面回歸核實課徵。
在美牛案以表決過關後，立法院臨時會下午繼續處理《所得稅法》部分條文修正草案，宣告明年1月1日正式復徵證所稅，不過，在野黨對國民黨版本證所稅多有不滿，在派代表發言結束後，民進黨及台灣團結聯盟立委集體高呼「欺世盜名、不公不義」口號，隨即離開議場，以退席表達抗議，留下國民黨和親民黨立委進行表決，完成法案二讀、三讀。
台聯黨團總召許忠信在表決前發言表示，證所稅未課徵已經造成股市動盪，可見目前並非適當復徵時機；親民黨團總召李桐豪則痛批，馬英九是為了虛名硬要推動證所稅，將摧毀對台灣非常重要的中小企業，親民黨感到非常遺憾；民進黨立委李應元指出，國民黨的證所稅版本完全喪失證所稅精神，既無量能課稅原則、也不符公平正義，應該要退回財政委員會再進行討論。
國民黨立委賴士葆則說，朝野立委不要小看自己角色，大家正在寫歷史。他認為，目前最好的證所稅版本就是國民黨版，台聯、親民黨、民進黨的版本都不好；賴士葆坦言，國民黨版就是緩徵證所稅，等2年後經濟成長率到5%再來課徵也不持，而且IPO逃都逃不了一定課的到稅，大家應該給予支持和鼓勵。
最後，在議場內幾乎都是國民黨立委的情況下，無異議完成二讀、三讀通過《所得稅法》部分條文修正草案，根據通過的法條，證所稅將在明年1月1日起復徵，前2年即民國102、103年先採「設算所得」和「核實課徵」並行的雙軌制，等到實行2年後的民國104年1月1日起，回歸到單軌制，全面實施「核實課徵」。
據了解，針對大部分股民的「設算所得」採就源扣繳，繳納稅率在千分之0.2到0.6間；如果台股指數達到8500點以上，須按股票賣出所得扣繳千分之0.2；台股達9500點以上，需扣繳賣出所得千分之0.4；當台股達1萬500點以上，則按股票賣出所得扣繳千分之0.6。
另一部分的「核實課徵」針對4種對象進行強制核實課徵，包括出售10張以上、在民國102年以後掛牌的初次上市上櫃股票 (IPO)、出售未上市櫃股票、賣出100張以上的興櫃股票，以及非在中華民國境內居住的個人，採分離課稅，稅率為15％，長期持股滿1年以上減半課徵（稅率7.5％），IPO部分持有超過3年再減半（稅率3.75％）。
至於民國104年則取消「設算所得」部分，全面回歸「核實課徵」，證所稅採單軌制進行，課徵對象再增加1條件，為全年出售證券金額超過10億元以上的個人。且當年度盈虧互抵。而在法人部分，採最低稅負制，稅率為12％到15％，免稅金額為新台幣50 萬元，長期持有3年以上者，享減半優惠。