教育部長蔣偉寧日前公開表示，不同類型的大專院校應有不同的定位，大專院校若以單一標準評鑑，會讓大學失去多元價值。教育部目前積極思考將大學評鑑「去指標化」，由各校自行建構良好的自評機制。
教育部高教司司長何卓飛補充，目前規畫大學自評從七月起正式推動，教育部會優先鼓勵或頂尖計畫補助與教學卓越獎勵的大學，向教育部提出完整自我評鑑辦法，經教育部審核通過後，未來可免於接受高教評鑑。
何卓飛表示，國際間有許多評鑑機構都相當認可台灣的高教評鑑，不可否認評鑑確實會影響大學正常校務運作，但若評鑑結果良好，也能替學校換來國際間的知名地位。
一名大學人員感嘆，為迎戰評鑑，動員數十名教學助理和工讀生整理資料，相關評鑑文件滿到辦公室放不下，特別加訂櫃子來裝。最麻煩的是，有時評鑑資料不夠充實，硬著頭皮拼湊內容，還要練習如何快速、準確回答評鑑委員的問題。
政大教育系教授秦夢群認為，目前的高教評鑑制度過於僵化，無論是教學型大學與研究型大學、人文學校與理工學校，還是新建大學與歷史悠久的學校，通通擺在同一套遊戲規則中評比。
在這股歪風底下，秦夢群指出經常耳聞私立大學為不被扣補助款與減少招生名額，寧可花大錢聘商業顧問公司幫忙做評鑑資料。也有學校以評鑑標準要求老師論文產出量，年輕教授只好把九十％心力放在研究上，反而輕忽了對學生的教學輔導。