行政院人事行政總處表示，聘用人員聘用條例第7條第2項係規定機關「法定主管職務」始有其限制，又所稱「法定主管職務」是指機關組織法規內「明定有職稱、官職等」之「正式單位」主管職務人員，但是，行政院雲嘉南聯合服務中心依行政院處務規程規定，係屬常設性任務編組性質，非正式單位，且該中心執行長及副執行長均屬兼任職務，未定有官等職等。
行政院人事行政總處另表示，組織基準法所指任務編組所需人員由相關機關人員派充或兼任之「相關機關人員」，非以常任公務人員為限，尚含括各機關以契約方式進用之聘用及約僱人員。且行政院雲嘉南聯合服務中心設置之執行長、副執行長係依行政院處務規程規定，為整合行政院所屬機關（構）當地現有資源，以單一窗口提供各該地區民眾便捷服務之需要而置，所辦理業務以協調、整合行政院所屬機關（構）各自權責事項為主，實際政策之規劃與執行仍回歸各部會法定職權定之。所以，行政院雲嘉南聯合服務中心之執行長、副執行長如由聘用人員擔任，並無違反聘用人員聘用條例及組織基準法規定。
訊息來源：行政院人事行政總處