當年提案人、監委程仁宏受訪時以「非常遺憾」回應，並指兩週內會行文衛生署對糾正案發出至今兩年，其具體做法及改善進度為何？若調查發現衛生署確有行政怠惰之實，而上級的行政院又未盡督導之責，不排除要求衛生署長及行政院官員，到監察院接受監委質問。
二十日健保局會議中，醫界質疑血液基金會成本分析不夠公開透明，反對通過一．九八億元的ＮＡＴ健保專款預算；血基會則稱年年公開財報，成本通過官方審查，絕無黑箱，雙方僵持不下，主席裁示退回健保費用協定委員會，重回原點。
愛滋感染者權益促進會秘書長林宜慧強調，ＮＡＴ預算已從五、六億縮減到一．九八億，醫界監督是好的，但若質疑其成本分析不夠透明而反對，是嚴重指控，須提出相當證據；主管血基會的衛生署更應說明，且衛生署不該任由兩造互咬破局，卻閃躲迴避，枉顧國人用血安全！
林宜慧疾呼，當年承諾推動的行政院長吳敦義，已是副總統，最有責任指示行政院出面協調或重新議價，若國人因輸血衍生生命健康和財產遭威脅，國家賠不起，更會造成未來愛滋醫療給付的財政負擔。總統府回應指出，這方面的問題由行政部門說明。
血液基金會處長林敏昌受訪亦指，血基會依衛生署指示辦理ＮＡＴ篩檢計畫，過程中衛生署卻事不關己，演變成血基會必須去拜託醫院同意，「莫名其妙，究竟誰才是主管機關？」
衛生署公關室主任王哲超表示，捐血ＮＡＴ全面篩檢政策各界已有共識，健保費用協定委員會亦已通過專款，只是醫界質疑篩檢價格還可再降，衛生署將再與血基會、醫界代表開會，以設法促成ＮＡＴ篩檢早日實施。