國立中興大學獸醫學系成立於民國五十九年，於民國七十一年成立獸醫學研究所同時開始招收碩士班學生。為了增加學生對動物疾病診療實習機會及加強對社區之服務需要，於民國六十九年興建獸醫教學醫院，不僅提供學生完善之各種動物疾病診治實習機會，並且配合政府政策積極推動鄉村之動物醫療保健宣導服務工作。 　　系所除大學部外並開設碩士班及博士班，大學部主要的教學方向著重在獸醫基礎醫學相關知識、副臨床醫學相關知識以及醫療及診斷相關知識；碩士班及博士班則著重於動物醫學專業知識、研究創新能力與專業知識自我學習能力。系上除教導學生相關學校教育，亦配合政府之農業推廣服務政策執行人才培育之訓練計畫，並讓學生參與禽畜保健、檢疫、防疫等工作。 　　獸醫師在現代社會所扮演之角色日趨重要及多元化，已不再只是為動物疾病之診治而已。由於社會對於、肉品衛生檢查、動物疾病檢疫防疫、人畜共同傳染病防治、以動物模式研究人類疾病及環境生態保育等方面之需求將愈來愈殷切。因此為因應時代之需求，又於八十三年度另成立獸醫微生物學研究所，且於八十七學年度又成立獸醫病理學研究所，並於翌年加上獸醫教學醫院聯合成立獸醫學院，九十二學年度再奉准成立獸醫公共衛生學研究所，使獸醫學教育能符合先進國家之水準與規模。