投票首日天氣晴朗，早上八點開始，有人怕投票隊伍太長，還自備椅子與報紙。投票開始過幾小時後，投票所外仍有排隊人潮，女性更是踴躍。全埃及一萬三千個投票所，有選舉權國民有五千萬人，投票將在當地時間廿四日晚間八點結束。
人生中第一次投總統選票，許多選民既興奮又開心，七十歲老太太說：「我這輩子第一次投票，我想要看到國家進入新時代，我想要改變。」亞歷山卓小巴士自願免費載民眾到投票所，司機說：「今天車費我來出。埃及人終於可以決定自己的命運了。」五十八歲伊卜拉辛說，他有癌症，沒幾個月可活了，「我來投票是為了小孩，讓他們活得更好，像個人。」埃及人樂見總統候選人與平民一起排隊等待投票，和穆巴拉克時期徒具形式的投票過程迥然不同。看到候選人之一的前外長穆沙站在投票隊伍中，支持者高興地表示：「說實在，可以和未來的總統一起排隊實在太棒了。」各地投票所都有警方協助維持秩序，投票過程平靜。首都開羅東北方一處投票所發生槍擊，一名警員死亡，但稍後官方宣布槍殺事件與選舉無關。
此次參選的候選人多達十二人，選前民調稱有近四成選民到投票日當天仍沒決定要投誰。由於沒有可靠民調，無法預測哪位候選人會勝出，不過支持率最高的四位候選人有象徵穆巴拉克舊勢力的前總理沙菲克、穆斯林兄弟會的穆希、前外長與阿拉伯聯盟秘書長穆沙、溫和的伊斯蘭主義者福圖赫。首輪預料不會有候選人囊括過半票數，六月十六日與十七日將舉行第二輪投票，大選結果會在六月廿一日公布。掌權的軍方承諾在七月一日交出政權。
新總統舊體制 改革大挑戰
儘管總統大選會是埃及政權轉移的最後階段，但埃及邁向民主之路仍是顛簸不平，新上任的總統須重新立憲，劃分總統、政府、國會、司法機關、軍隊的權責範圍。解決經濟問題也是一大挑戰，埃及由於革命動亂，通膨率達十二％，外匯存底縮水，觀光業也衰退了三分之一。軍方是否願意放棄長久握有的特權也遭到質疑。
最能代表推翻穆巴拉克政權的革命世代的候選人、人權律師阿里，這次根本沒有勝選機會。他的支持者質疑，未來埃及將是「新總統、舊體制」，他們也揚言，絕不放棄監督與施壓。