全球已知蝙蝠種類約1200種，而臺灣地區目前已知的蝙蝠超過35種，其中臺灣特有種及特有亞種就超過19種，這次「星空怪獸-蝙蝠傳奇」特展透過多媒體藝術牆、玻璃雕刻、3D立體影像、燈片、化石模型和生態影像等方式呈現，全方位剖析蝙蝠的奧秘，瞭解蝙蝠的獨特性及對生態的貢獻。
動物園在蝙蝠的研究方面，曾獲得臺北市政府99年度自行研究計畫優等，以「臺北市立動物園次生林內臺灣管鼻蝠微棲地選擇」為研究主題，發現管鼻蝠日間之棲息場所以筆筒樹枯枝最高，月桃枯葉與綠竹枯竹筒次之。動物園環境開發低和干擾少，正好提供蝙蝠一個可以棲息和覓食的場地，而蝙蝠也是目前本土動物中被瞭解最少的一群。
特展分成蝙蝠的起源、全球的蝙蝠、臺灣的蝙蝠、蝙蝠妙相和蝙蝠與人類的經濟等內容，看完特展，你會對蝙蝠有完全不同的印象。蝙蝠外形比較不討喜，但在生態上扮演著很重要的角色，除了控制昆蟲的數量之外，許多的植物是藉由蝙蝠來傳粉和繁衍的，蝙蝠每晚可吃掉1000隻昆蟲，是生物防治高手；邵氏長鼻蝠是龍舌蘭唯一的傳粉者；有20多種野生香蕉完全只能靠蝙蝠傳粉；水果之王榴槤也是靠當地的果蝠傳粉才能繁衍。蝙蝠在熱帶森林中扮演舉足輕重的角色，對人類經濟貢獻很大。
蝙蝠分為兩個亞目，翼距從14公分到200公分左右都有，大翼手亞目的眼睛大、視力好，主要依靠視覺來辨認物體，通常以果實及花蜜為食；小翼手亞目通常視力退化，主要依靠回音定位來辨識物體，除了食蟲外，還有以肉、魚、蛙和鳥等為食，以及行為酷似蜂鳥的食花蜜蝙蝠。臺灣的蝙蝠有不少種類生存於森林內，包括樹棲型或岩洞棲息的蝙蝠，蝙蝠的形態、生理及行為十分獨特，但多數生態仍不太清楚。難得一見的蝙蝠特展，讓你能在短時間內對這種東方的吉祥動物和西方的邪惡象徵，有一個全新的體認。