陳玲鈴發表標題為「沒有言論自由和公平選舉的『頂尖典範大學』校長遴選」的一封「致陳希舜校長的公開信」，內容指出，校長遴選委員會44名候選人名單在投票前一小時才公布，「有必要這麼保密嗎？」候選人中有30名是校外人士，「一個人的資料看不到2分鐘，這樣能投票嗎？」她認為此舉並不符合在一週前提供資料，以及投票前須有「公開」及「充分資訊」的慣例原則，合理懷疑選舉已經被操作。
其次，根據「國立台灣科技大學校長遴選辦法」第二條第一項規定，校長不再續任時，校長遴選委員會應於任期屆滿前10個月組成；台科大校長明年2月1日卸任，理應4月1日就該組成遴選委員會，卻至4月20日才投票選出代表，顯然已違反規定。
陳玲鈴也表示，大學法修正後曾明訂「校長遴選委員會之組成，任一性別委員應占委員總數三分之一以上」，但是台科大的相關公文中從未提及性別比例，讓許多系所遺憾未能提名優秀女性參選，反倒讓有心人士得以操作排入名單，要求教育部主動調查。
署名「佩服」的網友回應陳玲鈴公開信說：「我是當天與會的校務會議代表，也很憤慨，但只能無奈接受。搞不懂陳校長的目的是什麼？是要保他所挑選的繼承人？還是維持他卸任後的影響力？」
台科大校長陳希舜坦言投票前一小時才公布名單，但校外候選人都有推薦單位在場提供諮詢，「問到清楚後再投票」，避免候選人遭到黑函等困擾，陳玲玲說詞顯然避重就輕。
陳希舜並表示，台科大的作法是事先不去刻意保護女性，「這樣無疑事先就歧視女性了」，這次選出的15名遴選委員有6名女性，證明「我們做得很好」。他也說，對於傷及台科大的指控言論，將委託律師依法處理。
教育部政次林聰明表示，大學校長遴選有一定的程序，教育部迄今不清楚台科大校長遴選的爭議，不過會提醒學校要妥適地按規定的程序進行。