周刊報導，呂秀蓮自認掌握許多破案關鍵。她表示，李昌鈺是用彈孔一四七公分和高腳椅一四○公分當基準，做出「彈道從吉普車之前，往後方下傾約四度，並和車子右側夾角五十四度方向，由右往左射擊」的結論。
呂秀蓮說，但李昌鈺忘記她右腳受傷，所以車座上還有兩個礦泉水紙箱給她墊腳，她的膝蓋不是下垂而是上揚，而且足足比高腳椅高了十公分。所以槍傷的位置，應該高於擋風玻璃上的彈孔，所以彈道是上揚而非下傾。
呂秀蓮還質疑「撿彈殼」的過程，是檢警辦案的盲點。她表示，發現彈殼的民眾中，有一位林姓男子，他是檢擊熱區附近「小莓檳榔攤」老闆的兒子。這個老闆二○○三年因持有改造貝瑞塔手槍被抓過，和三一九槍擊案的手槍是同一型。
呂說，老闆後來還指認黃衣禿頭男，在他店前面手持不明物品，很多證詞都是他講出來的，檳榔攤跟三一九案究竟有無關聯，為何沒有仔細調查？