策劃劫持民航機撞擊紐約世貿中心和華府五角大廈的主謀哈立德、負責挑選與訓練劫機者的瓦立德、「基地」恐怖組織主要連絡人拉姆齊，以及作案資金調度運用者穆斯塔法與阿里阿布杜五人，將在五日獲正式通知，他們的案件將一併交由軍事法庭審理。基地的軍法官會在一個月內提訊。
關於本案應否交軍法審判，已歷經十年的政治與法律論戰。最激烈爭辯的議題在於，像哈立德等五名恐怖犯嫌，究竟應像一般罪犯一樣接受平民的司法審判，或者應當視為敵方戰鬥人員，軍法審理。
這個奪走二千九百七十六人生命的案件交付軍法審判，對於今年要競選連任的歐巴馬總統形同兩面刃。歐巴馬雖然下令圍捕並擊斃主使九一一事件的「基地」組織首腦賓拉登，但他二○○八年競選總統時承諾，要在上任後第一年內關閉發生虐囚醜聞的關達那摩灣監獄，後來並未能實踐諾言。
本案爭議層出不窮。哈立德等五嫌二○○六年被移送到關達那摩灣前，曾被關押在美國中央情報局的祕密監獄，中情局坦承曾對哈立德等人施以「水刑」逼供。
軍事檢察官在二○○八年起訴五嫌，並向軍事法庭求處死刑。反對軍法審判的歐巴馬出任總統後，司法部長霍德曾將本案轉移給紐約的聯邦法庭審理，軍事檢察官也隨之撤銷告訴。
然而，本案移交平民司法審判遭國會堅決反對。國會並封殺聯邦法庭審理此案所需預算，擋下以審判或任何理由將哈立德等人從關達那摩灣移送美國本土的計畫。
白宮發言人表示，歐巴馬並沒有背棄關閉關達那摩灣監獄的承諾，譴責國會的阻力使這座監獄仍持續運作，但強調獄中關押的高危害性恐怖犯嫌已從歐巴馬就任時的二百五十二人，減少到一百七十一人。