滕西華指出，十七％會被加收到補充保費者多不是有錢人，首當其衝的是失業人口，只要打個零工、收入超過二千元，就會被課補充保費。甚至為償還助學貸款的學生課餘打工，薪水也將被課補充保費。二代上路後，更可預期未來不再有員工福利，因為所有福利都要加收補充保費。
公平稅改聯盟召集人王榮璋也批評，補充保費執行面上困難重重，尤其同樣增加收入者卻有人可免收補充保費，更是很大的不公平。若無法順利收取補充保費，費率又再下降，苦果都要由後代子孫背負，政府一意孤行就要勇於承擔所有後果、為政策負責。
一位不願具名的財稅專家也批評，二代健保延後上路也無法解決費基不公平的問題，尤其二代健保是否可行仍是很大問題。前衛生署長楊志良認為，健保未來修法仍應回歸「家戶總所得」進行討論，才能較符合公平正義。
楊志良表示，九十九年推動二代健保修法時，以五年財務平衡為費率計算基礎，現在時間已過了兩年，五年財務平衡時間也只剩下三年可打平。
他說，若每年健保總額以兩百多億計算、醫療費用成長率為四％，健保總額很快就會「爆掉」。一旦失業率上升、民眾薪資下降，補充保費收取也會跟著短少，既有費率也恐無法支應健保總額的支出，重申健保仍應回歸家戶總所得討論。