特偵組在扁辦與台北看守所查扣一○二箱文件資料，包含來自行政院、外交部、國防部、調查局、警政署等單位的機密文件；特偵組耗時一年清出涉及國家機密的文件共計一萬多件，應扁要求逐一提示供他表示意見。
上月十四日，特偵組首度提訊在監的陳水扁，但扁稱「胃不舒服」，庭訊提前結束；上月廿一日檢察官改至北監就訊，扁再稱身體不適，數日後戒護就醫。
檢察官在上周五再赴北監了解扁的身體狀況，獄方評估他一切作息如常，且會見民代親友頻繁，應可接受偵訊。特偵組檢察官於是赴北監就訊。
檢察官昨日上午九點四十分抵達北監開庭，扁在律師陪同下出庭，神情氣色看來正常。檢察官一開口就詢問扁身體是否無恙，扁回稱沒有問題後展開庭訊，近兩小時庭訊，扁未表達身體不適，與前兩次一開庭就表明「胃不舒服」要求改期的狀況不同。面對檢察官提示的扣案機密公文，扁一一充分解釋，顯得思慮清晰，整場庭訊幾乎都被扁答辯時間占滿，與日前有立委指稱扁記憶有問題、注意力無法集中等狀況，明顯有差距。