澎湖沿岸為大陸棚地形，遭到持續性低溫，就容易爆發寒害，民國九十七年、一百年都曾爆發寒害，導致養殖魚種有「新國民魚」之稱的海鱺魚，業者損失慘重，而海鱺魚不耐十四度以下低溫，每年春節前後採收期，都受到低溫寒害的威脅，因此澎湖各界也興起更換養殖魚種的呼聲，避免寒害造成養殖業者重大損失。
澎湖海洋生物研究中心表示，澎湖內海若測得極限低溫十三．七六度，並持續超過一星期以上，就會呼籲沿岸養殖業者嚴防寒害，澎湖已歷經兩次寒害，證明政府大力推廣的養殖主力海鱺魚不耐低溫，低於十四度以下就可能死亡，同時因箱網養殖多數沉底，五天後才會陸續浮上海面，因此初期看不出來，海面下卻傷亡慘重，養殖魚種及方法都有待進一步改善。