國民黨馬吳配這次在新北市及台北市共獲得217萬7千多票,光是在雙北就大贏對手民進黨正副總統候選人蔡英文、蘇嘉全53萬2千多票,扣掉在高雄及台南輸給英嘉配的34萬8千多票,仍多出18萬多票,奠定勝基。在中彰投地區,藍軍仍佔優勢,領先4%至6%,顯示國民黨要在「北部大勝、南部小輸、固守中部」的策略奏效。
馬英九在台北市的得票率向來很高,這次除了大同區,在其他各區的票數都勝過蔡英文。在吳敦義的故鄉南投,馬吳配雖未贏到國民黨揚言的5萬票,也有3萬5千多票。至於蔡英文及蘇嘉全的故鄉屏東,民進黨則贏了6萬票。
這次是繼2000年以來,第一次有3組候選人競選,但結果未呈現「三足鼎立」之勢。親民黨宋林配的得票壓縮到3%以下,棄保效應發酵,使得藍綠對決態勢不變。
在區域立委方面,國民黨在彰化以北的45席中拿下37席,只掉了8席。其中,在桃園縣6席全上,並囊括基隆市、新竹縣市、苗栗縣、南投縣、花蓮縣及金門縣的席次。民進黨則依舊稱霸南部,在台南市5席全包,高雄市9席中也搶下7席。加上不分區立委,國民黨在國會113席中佔64席、民進黨40席、親民黨及台聯各3席、其他3席。國民黨在國會依舊穩定過半,維持完全執政的態勢。
在政黨票部分,只有國民黨、民進黨、台聯及親民黨跨過5%的門檻,獲得不分區立委席次,其餘7個政黨全軍覆沒,再次證明在現行選罷法規定下,小黨幾無生存空間。