國內資料顯示，平均每天有30人被宣佈得到大腸癌，有13人因大腸癌死亡，97年新診斷大腸癌個案有11,004人，大腸癌已成為癌症發生人數的榜首，平均發生年齡為68歲，其中50歲以上有9,571人佔所有大腸癌人數的87%。為降低大腸癌對國人健康威脅，衛生署邱文達署長表示，自民國99年1月起全面提供50-69歲民眾2年1次免費糞便潛血檢查(大腸癌篩檢)，民眾只要持健保卡至健保特約醫療院所，即可獲得該項服務。
國民健康局邱淑媞局長表示99年1月起至100年10月底，有166萬7,607名50-69歲民眾接受糞便潛血檢查，其中男性約70萬人，低於女性的96萬人；篩檢結果有11萬7,681名陽性個案(陽性率7%)，其中男性陽性有6萬3,421人(陽性率9%)，高於女性5萬4,260人(陽性率5.6%)；這些陽性個案截至目前男女性已有58%完成後續大腸鏡等確診。確診結果已發現3萬3,193名大腸息肉以及3,240名癌症，男女性分別發現2萬851人、1萬2,342名的大腸息肉，以及1,898名和1,342名癌症。
由前述糞便潛血檢查陽性個案確診發現的大腸息肉與大腸癌結果，假設所有陽性個案都完成大腸鏡確診，則透過糞便潛血檢查約每篩檢30名50-69歲民眾，可發現1名有大腸息肉；每篩檢300名50-69歲民眾約可發現1名大腸癌。另外由國內資料發現，糞便潛血檢查陽性個案，每20個陽性中就有10人已有大腸息肉與1人已有大腸癌，顯示糞便潛血檢查陽性個案確實為大腸癌的高危險群，然而國內卻有高達4成的糞便潛血檢查陽性民眾，後續不願意再進一步做大腸鏡檢查，原因有民眾自覺健康沒有任何異狀，害怕大腸鏡檢查疼痛、沒時間安排檢查等。
邱淑媞局長表示早期大腸癌並沒有任何異常狀況，如果等到出現大便有血、排便習慣改變、腹痛、裏急後重等情形，往往已是大腸癌第三期或第四期了。因此政府提供大腸癌篩檢就是希望在民眾沒有任何症狀下，可以透過糞便潛血檢查找出陽性個案，而陽性個案透過大腸鏡檢查可以早期發現是否有大腸息肉或是早期大腸癌，如為大腸息肉經過切除治療後可以避免惡化成癌症，早期大腸癌(0期和1期)其5年存活率都可高達81%以上，因此陽性民眾千萬要去做大腸鏡檢查，如果害怕疼痛，可以自費選擇無痛大腸鏡檢查。
國內大腸癌男女標準化死亡率每10萬人口為17.2人與12.5人，相較美國的9.9人與7.7人偏高，另國內男女五年整體存活率為59%與61%，也相較美國男女的65%偏低，究其原因為國人男女近2年大腸癌篩檢率只有27%與36%，相較美國大腸癌篩檢率的6成偏低。降低大腸癌對於國人健康威脅，衛生署邱文達署長呼籲民眾，政府已提供50-69歲民眾每2年1次糞便潛血檢查，請民眾善用該檢查。尤其是男性朋友更要出來接受檢查，因為男性篩檢率相較女性低了9%，且男性陽性率又較女性高，因此請大家鼓勵男性親友多多善用糞便潛血檢查；此外糞便潛血檢查結果陽性者，請儘速持健保卡就醫進一步做大腸鏡檢查，以達早期篩檢早期治療之成效。